出生于江苏省苏州特区昆山县八城乡。小时候，他梦想成为一名艺术家。高中未毕业，1982年他开始在中国人民解放军（PLA）服役。他以优异的成绩毕业于航空学校和航空教官高等学校。费俊龙成为中国最优秀的飞行员之一。他曾担任战斗机飞行员、教官和检查员。作为检查员，他参与了各种航空事故的调查。他获得了上校军衔。
1998年1月，费俊龙从1500多名中国最优秀的飞行员中入选航天员。在太空飞行训练期间，他表现出了出色的能力。他是为神舟五号飞船中国首次载人飞行做准备的五名宇航员之一。
2005年10月12日至16日，他与聂海生一起作为神舟六号飞船的指挥官进行了航天飞行。他于 2012 年离开了宇航员部队。
